Ewerthon empezó su carrera futbolística en el Corinthians brasileño en el año 1999. Estuvo en ese club dos temporadas, hasta que le fichó el Borussia Dortmund de Alemania.

Desde 2001 hasta 2005 ha estado Ewerthon hinchándose a marcar goles en la 1. Bundesliga, llegando ha ganar una liga en 2002 y siendo finalista de la Copa de la UEFA en esa misma temporada.

La temporada 2005 - 2006, ficha por el Real Zaragoza, donde forma una dupla letal en ataque junto con Diego Milito. Con el club maño consiguió en su primer año, tras una gran actuación en la ida de las semifinales contra el Real Madrid, quedar finalista de la Copa del Rey, perdiendo en la final ante el Espanyol por 4 - 1.

En julio 2007 Ewerthon llegaba al VfB Stuttgart cedido por un año. Pero en enero 2008 el préstamo se termina prematuramente. Ewerthon llegaba al Real Club Deportivo Español de nuevo cedido hasta el final de la campaña.

Ewerthon podría jugar la temporada 2008/2009 cedido en el Málaga Club de Fútbol, a la espera de que se cierren las negociaciones entre ambos clubes.